Das Musikwissenschaftliche Seminar wird geleitet von einem Vorstand aus Hochschullehrerinnen und Hochschullehrern, akademischen Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern, Studierenden und Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter in Technik und Verwaltung, unter Vorsitz einer geschäftsführenden Leiterin bzw. eines geschäftsführenden Leiters aus der Gruppe der Hochschullehrerinnen und Hochschullehrer: 
Prof. Dr. Andreas Münzmay (GL); Prof. Dr. Antje Tumat (Stellv.); Prof. Dr. Rebecca Grotjahn; Vertr.-Prof. Dr. Martin Loeser; Prof. Dr. Joachim Veit; Dr. Vera Grund (akad. Mitarb.); Kristina Richts-Matthaei (Stellv.); Lena Frömmel (Stud.); Ricarda Hörig (MTV)