Das Musikwissenschaftliche Seminar wird geleitet von einem Vorstand aus Hochschullehrer*innen, akademischen Mitarbeiter*innen, Studierenden und Mitarbeiter*innen in Technik und Verwaltung, unter Vorsitz der in zweijährlichem Turnus gewählten Geschäftsführenden Leitung aus der Gruppe der Hochschullehrer*innen:
Prof. Dr. Antje Tumat (GL); Prof. Dr. Rebecca Grotjahn (Stellv.); Prof. Dr. Dominik Höink; Prof. Dr. Andreas Münzmay; Prof. Dr. Joachim Veit; Dr. Kristina Richts-Matthaei (akad. Mitarb.); Daniel Jettka (Stellv.); Ricarda Hörig (MTV); Anne Warkentin (Stellv.); Hannah Otto (Stud.); Lena Petri (Stellv.)