Das Musikwissenschaftliche Seminar wird geleitet von einem Vorstand aus Hochschullehrer*innen, akademischen Mitarbeiter*innen, Studierenden und Mitarbeiter*innen in Technik und Verwaltung, unter Vorsitz der in zweijährlichem Turnus gewählten Geschäftsführenden Leitung aus der Gruppe der Hochschullehrer*innen: Prof. Dr. Dominik Höink (GL); Prof. Dr. Johannes Kepper (Stellv.); Prof. Dr. Axel Berndt; Prof. Dr. Rebecca Grotjahn; Prof. Dr. Andreas Münzmay; Prof. Dr. Anna Plaksin; Prof. Dr. Antje Tumat; Melissa Maria Korbmacher (akad. Mitarb.); René Pauls (Stellv.); Dunja Jeske (MTV); Anne R. Warkentin (Stellv.); Lorenz Münch (Stud.); Isaak Dieme (Stellv.)