Als gemeinsame Einrichtung der Universität Paderborn und der Hochschule für Musik Detmold widmet sich das Musikwissenschaftliche Seminar dem Studium und der Erforschung von Musik und Musikkultur. Im Zentrum stehen dabei vier universitäre musikwissenschaftliche Studiengänge:

• Bachelor Musikwissenschaft (mit künstlerischem Studienanteil an der HfM),
• Fach Musikwissenschaft im Zwei-Fach-Bachelor Kulturwissenschaften,
• Master Musikwissenschaft,
• Fach Musikwissenschaft im Zwei-Fach-Master Kultur und Gesellschaft.

Hinzu kommt die musikwissenschaftliche Lehre in zahlreichen weiteren Studiengängen wie Populäre Musik und Medien, Lehramt Musik, instrumentalpädagogische/künstlerische Studiengänge sowie Digital Humanities.
Ein prägender Faktor für das Musikwissenschaftliche Seminar ist ebenso die Forschung. Besondere Schwerpunkte unter den vielfältigen Forschungsaktivitäten bilden Langzeitprojekte im Bereich der Editionsphilologie, die digitale Musikwissenschaft, die musikwissenschaftliche Genderforschung und das Musiktheater. Gegenwärtig lehren und forschen am Musikwissenschaftlichen Seminar rund dreißig Wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter, Professorinnen und Professoren. Von der unmittelbaren Nähe zur aktuellen Forschungspraxis wie von der direkten Verbindung mit der künstlerischen Praxis der Musikhochschule profitiert die Lehre auf allen Niveaustufen vom Bachelor- bis zum Promotionsstudium.
Der Standort im Detmolder FORUM Wissenschaft–Bibliothek–Musik garantiert eine besondere Arbeits- und Studienatmosphäre, nicht zuletzt durch die hervorragend ausgestattete neue Musikbibliothek, die unter anderem Institutsbliothek des Musikwissenschaftlichen Seminars ist und in dieser Funktion von Hochschule und Universität gemeinsam betreut wird.